雖然實驗室超純水機安裝與操作較為簡單，但有些技術流程步驟不可忽視，操作不當將直接影響產水質量甚至會影響實驗結果。

設備安裝

實驗室超純水機應安裝在防水臺面或特制的車架上，遠離有源儀器設備。在不與RO純水機組合使用的情況下，供水容器要高于純水機組合使用的情況下，供水容器要高于純水機10-20cm，采用無毒硬質，避免過多的中間接口以防止水污染或污垢積聚，供水容器要洗刷干凈并用蒸餾水或RO水涮洗處理，出水口處下方需放置積水盤。

電源連接

直接將主機電源線插到墻壁電源插座，但必須保證電源確有底線，如果未接地線應將主機另行接地；使用接線板為防水插座或置接線板遠離可能濺到水的區域。

裝載或更換純水柱

在斷電或電源開關關閉狀態下完成裝載或更換純水柱，事先核對純水柱的規格型號是否與本機性能要求相符，檢查純水柱接口端的密封膠圈有否脫落并置于是當的對接位置。

操作注意事項

必須保證裝入源水容器內是雙蒸水或RO水，電導率<10μS/CM@25℃或低水溫在5-35℃之間；且不要把轉運容器中的水底倒入源水容器，以免殘留在水桶或其他容器底部的顆?；蛐鯛钗镞M入純水柱導致柱效降低。

實驗室超純水機運行

開機后儀器會運行除氣泡程序，耗時約為5min，約需15L水。如果配置了UF組件儀器則隨之進入清洗程序，約需60min之后，在預操作轉態下過夜或至少維持數小時，儀器自循環清洗純化柱。次日，進入超純水機操作轉臺，產水10-15L后置預操作狀態待用。